成果/Result
- 纳米通道单分子检测P53蛋白与DNA的弱相互作用被引量：16收藏
- 作者：应佚伦 张星 刘钰 薛梦竹 李洪林 龙亿涛
- 机构：华东理工大学上海市功能性材料化学重点实验室;华东理工大学药学院;中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心
- 来源：《化学学报》 2013
- 关键词：纳米通道单分子检测技术 α-溶血素 P53蛋白 弱相互作用
- 摘要：利用基于α-溶血素(α-HL)的纳米通道单分子检测技术在单分子水平上探测位于肿瘤抑制蛋白P53 DNA结合域的多肽分子(P53-P)与含有p21waf1/cip1基因结合域的双链DNA(B40)之间弱相互作用.在电场力的...
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- 基于GPU的矩阵求逆性能测试和分析被引量：11收藏
- 作者：刘丽 沈杰 李洪林
- 机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院
- 来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》 2010
- 关键词：图形处理器(GPU) 计算统一设备架构(CUDA) CPU 并行运算 矩阵求逆
- 摘要：在CPU串行运算模式下实现大规模矩阵求逆是一个非常耗时的过程。为了解决这一问题,基于NVIDIA公司专为GPU(图形处理器)提供的CUDA(计算统一设备架构),从新的编程角度出发,利用GPU多线程并行处理技术,将矩阵求逆...
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- 丁苯那嗪调节TH和突触囊泡转运改善HD的机制研究被引量：4收藏
- 作者：王如意 范晶菁 李洪林 王蕊
- 机构：华东理工大学药学院
- 来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》 2023
- 关键词：亨廷顿舞蹈症 3-硝基丙酸 丁苯那嗪 多巴胺
- 摘要：通过腹腔注射3-硝基丙酸(3-NP)建立亨廷顿舞蹈症(HD)大鼠模型,探究丁苯那嗪(TBZ)改善HD样症状的作用及机制。结果显示,TBZ缓解了3-NP诱导的HD大鼠体重下降和运动障碍,逆转了纹状体中亨廷顿蛋白(Htt)的...
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- 基于人工智能的药物-靶标相互作用预测被引量：4收藏
- 作者：杨朔 王洁 张梦婷 沈子豪 李洪林 李诗良
- 机构：华东理工大学新药设计重点实验室
- 来源：《中国现代应用药学》 2022
- 关键词：药物-靶标相互作用 深度学习 概率矩阵分解算法 靶标预测
- 摘要：目的建立一个高效的药物-靶标相互作用预测分类模型,为生物实验提供有力的补充工具。方法研究开发一种基于深度学习的方法来预测药物-靶标相互作用:通过引入高维分子指纹和蛋白质描述符,并应用概率矩阵分解算法生成负样本集,构建一个...
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- 药物潜在靶标识别与药物设计方法研究被引量：3收藏
- 作者：龚道鸿 唐建新 王保利 相苏桐 冯紫燕 李诗良 李洪林
- 机构：华东师范大学药学院;华东理工大学药学院
- 来源：《中国科学:化学》 2025
- 关键词：靶标识别 药物设计 人工智能 计算方法与平台 新药研发
- 摘要：药物靶标识别与验证是新药研发的首要环节,其关键挑战在于筛选出同时满足疾病机制关联性、结构可靶向性及成药潜力的生物分子靶标.通过早期且全面的靶标验证,可明确建立靶点调控与疾病治疗效应的因果关系.基于对靶标三维结构及功能特征...
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- 二氢乳清酸脱氢酶抑制剂的设计、合成和构效关系研究被引量：3收藏
- 作者：宫荥恢 刘莉 齐甜甜 李洪林 朱丽丽 赵振江
- 机构：华东理工大学药学院
- 来源：《药学学报》 2017
- 关键词：人类二氢乳清酸脱氢酶抑制剂 三氮唑衍生物 自身免疫性疾病 复合物共晶结构 构效关系
- 摘要：本文将实验室前期发现的1-丁酰基-3-(4-氯苯基)-5-甲硫基-1H-1,2,4-三氮唑作为人类二氢乳清酸脱氢酶(Hs DHODH)抑制剂设计的苗头化合物,为开展结构优化,首先培养并解析了苗头化合物与Hs DHODH的...
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- 可降解载药原位水凝胶在眼后段药物缓释的有限元分析被引量：2收藏
- 作者：竹鑫裕 段春争 李红霞 李洪林
- 机构：大连理工大学机械工程学院;华东理工大学药学院
- 来源：《医用生物力学》 2022
- 关键词：可降解原位水凝胶 药物缓释 眼后段
- 摘要：目的探究在水凝胶的降解行为下药物在眼后段的扩散过程,为评估局部药物浓度和优化可降解水凝胶的眼内释药性能提供研究基础。方法通过有限元分析法建立可降解载药原位水凝胶在眼后段的药物传递模型。模型考虑水凝胶的降解作用、眼内压和视...
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- 计算系统生物学:理论、方法及在药物研发中的应用被引量：2收藏
- 作者：刁妍妍 蔡超前 蒋华良 李洪林
- 机构：华东理工大学药学院;华东理工大学信息科学与工程学院;中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心
- 来源：《生命科学》 2010
- 关键词：计算系统生物学 生物模型 建模方法
- 摘要：计算系统生物学是一个多学科交叉的新兴领域,旨在通过整合海量数据建立其生物系统相互作用的复杂网络。数据的整合和模型的建立需要发展合适的数学方法和软件工具,这也是计算系统生物学的主要任务。生物系统模型有助于从整体上理解生物体...
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- 中药组成分资源和实验数据库研究被引量：1收藏
- 作者：李建华 刘智超 郑建丽 石泽智 范蜜 李洪林
- 机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学上海市新药设计重点实验室
- 来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》 2018
- 关键词：中药 组成分 数据建模 资源和实验库
- 摘要：目前已有的中药数据库缺乏中药组成分资源间的有效关联和实验支持。为此,针对植物类中药组成分,设计了一个面向组成分的资源和实验数据库。首先抽取关键的资源和实验数据,将其分为资源数据、实验能力数据和实验数据;然后定义各类数据内...
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- 基于信誉的新药发现平台信任机制被引量：1收藏
- 作者：范蜜 李建华 郭卫斌 李洪林
- 机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院
- 来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》 2015
- 关键词：信任机制 药物发现 联合研发 信誉
- 摘要：针对新药研发需要跨地域、跨学科合作的特点,建立了一个面向天然产物的新药发现平台。为了促进平台上各参与方进行联合研发,进而提高新药研发效率和成功率,需要支持参与方相互间进行可信度的评估,并在合作方间建立可靠的信任关系。本文...
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- 靶向PD-1的多肽阻断剂的设计及评价被引量：1收藏
- 作者：全丽娜 刁妍妍 李巧 李文杰 朱丽丽 李洪林
- 机构：华东理工大学药学院上海市新药设计重点实验室
- 来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》 2020
- 关键词：PD-1 多肽阻断剂 抗肿瘤 免疫疗法
- 摘要：以PD-1为靶标,设计了靶向结合PD-1的多肽P5-1;通过表面等离子共振(SPR)技术测得P5-1与PD-1的结合亲和力(KD)为0.21μmol/L,并通过分子水平竞争性实验验证P5-1可以阻断PD-1与PD-L1的...
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- 高盐饮食通过激活盐皮质受体引发Dahl SS大鼠肾损伤和高血压的新机制被引量：1收藏
- 作者：李曦 王蕊 李洪林
- 机构：华东理工大学药学院
- 来源：《华东理工大学学报(自然科学版)》 2024
- 关键词：高盐饮食 Dahl SS大鼠 盐敏感高血压 肾损伤 盐皮质激素受体
- 摘要：盐敏感高血压作为一种顽固性高血压,其发病机制十分复杂。虽然盐皮质激素受体激活和肾损伤在盐敏感高血压的发展中起关键作用,但具体的病理机制目前并不明确。通过高盐饮食诱导建立达尔盐敏感(Dahl SS)大鼠高血压模型,探究盐敏...
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- 不同剂量(+)-2-(1-羟基-4-环己酮)乙基咖啡酸酯对大鼠关节炎模型和全血炎症模型的药效学研究被引量：1收藏
- 作者：杨文 刘远儒 李洪林 王蕊
- 机构：上海市新药设计重点实验室
- 来源：《中国病理生理杂志》 2018
- 关键词：(+)-2-(1-羟基-4-环乙酮)乙基咖啡酸酯 胶原诱导性关节炎 花生四烯酸
- 摘要：目的:对(+)-2-(1-羟基-4-环己酮)乙基咖啡酸酯(HOEC)在大鼠关节炎模型上进行药效学评价,并利用大鼠全血花生四烯酸(AA)代谢模型,探究引起HOEC对关节炎的非剂量依赖性治疗作用的可能机理。方法:(1)采用大...
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- 基于三元残基组合对的蛋白质相互作用研究被引量：1收藏
- 作者：肖薇 何增辉 李诗良 李洪林
- 机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院
- 来源：《药学学报》 2017
- 关键词：蛋白质-蛋白质相互作用 “三棱柱”模型 三元残基组合对
- 摘要：蛋白质-蛋白质相互作用的作用机制对生命科学研究有着重要意义。目前已有的方法多偏向于氨基酸残基的偏好性研究,并没有给出对应的残基组合的空间信息,而这些空间信息对设计蛋白质-蛋白质相互作用至关重要。通过深入挖掘已有的蛋白质相...
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- 新型法尼基转移酶抑制剂的发现及构效关系分析被引量：1收藏
- 作者：张明 李诗良 朱丽丽 黄瑾 赵振江 李洪林
- 机构：华东理工大学药学院上海市新药设计重点实验室
- 来源：《药学学报》 2019
- 关键词：法尼基转移酶 抑制剂 虚拟筛选 构效关系分析
- 摘要：本文选择法尼基转移酶(FTase)作为靶标,利用计算机辅助药物设计Schr?dinger软件包中Glide v4.0程序进行虚拟筛选,获得了13个结构新颖、具备中等活性法尼基转移酶抑制剂(FTIs)苗头化合物。通过分析代...
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- 美他多辛通过MAPK增强线粒体功能降低酒精性肝病脂质蓄积被引量：0收藏
- 作者：王咏枝 李芸 郭伊菲 周园奇 李洪林 张健
- 机构：华东理工大学药学院
- 来源：《药学学报》 2026
- 关键词：美他多辛 线粒体损伤 脂质集聚 酒精液体饲料饮食 酒精性肝病
- 摘要：为探究美他多辛在酒精性肝病中抑制肝脏细胞脂肪变性的作用机制,本研究采用美他多辛灌胃治疗高脂高乙醇饮食诱导的酒精性肝病小鼠,通过肝脏组织的转录组测序(RNA sequencing,RNA-Seq)分析药物作用的通路;利用乙...
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- 基于等值面的分子溶剂可及表面快速生成算法被引量：0收藏
- 作者：龚家瑜 高大启 李洪林
- 机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院
- 来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》 2013
- 关键词：分子溶剂可及表面 等值面 高斯滤波 移动立方体
- 摘要：分子表面的描述在蛋白-蛋白、蛋白-配体相互作用分析中起着关键的作用。为此,本研究设计了基于等值面原理的分子溶剂可及表面生成程序并进行了性能测试。该程序采用一维递归快速高斯滤波计算方法,在三维离散空间中快速构造等值面,利用...
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- 新型长效DPP-IV抑制剂的发现与设计被引量：0收藏
- 作者：徐洪玲 李诗良 赵振江 徐玉芳 李洪林
- 机构：华东理工大学药学院、上海市新药设计重点实验室
- 来源：《中国药理学通报》 2015
- 关键词：抑制剂 国际糖尿病联盟 慢性非传染性疾病 设计 患病人数 一线治疗 Ⅱ型糖尿病 胃肠道紊乱
- 摘要：糖尿病是当前威胁全球人类健康的最重要的慢性非传染性疾病之一.据国际糖尿病联盟（IDF）的统计表明,目前全球约3.82亿人患糖尿病,仅2013年,全球有510万人死于与糖尿病相关的疾病,占所有死亡人数的8.39%.而中国2...
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- 二氢乳清酸脱氢酶抑制剂前药的合成和稳定性及活性评价被引量：0收藏
- 作者：单继伟 齐甜甜 李洪林 朱丽丽 赵振江
- 机构：华东理工大学药学院
- 来源：《药学学报》 2018
- 关键词：二氢乳清酸脱氢酶抑制剂 前药设计 药物稳定性 活性评价
- 摘要：本文以课题组前期发现的高活性DHODH抑制剂A为基础,依据前药合成策略,对其羧基进行酯化修饰得到12个前药分子,旨在优化化合物A的稳定性。分子水平抑制活性显示12个前药分子中只有A1~A5有微弱活性,与其作用机制和前药设...
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- 顺苯磺酸阿曲库铵(51w89)作为CD73抑制剂的发现及评价被引量：0收藏
- 作者：刘永杰 汤姜杨 朱丽丽 李洪林
- 机构：华东理工大学药学院
- 来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》 2023
- 关键词：CD73 抑制剂 肿瘤 迁移 CD8+T细胞
- 摘要：胞外5′-核苷酸酶(e5NT,又称CD73)是一个新兴的肿瘤治疗潜在靶点,与肿瘤的发生、发展、转移及不良预后密切相关。通过筛选发现顺苯磺酸阿曲库铵(51w89)可以抑制CD73的酶活性,其在分子水平的IC_(50)为(1...
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- 基于反向药效团匹配的网络药理学方法被引量：0收藏
- 作者：王霞 潘晨旭 龚家瑜 刘晓峰 李洪林
- 机构：华东理工大学药学院;华东理工大学信息科学与工程学院;上海市新药设计重点实验室
- 来源：《中国药理学通报》 2015
- 关键词：多向药理学计算 靶标识别 药效团匹配 配体-靶标打分矩阵 富集 概率评估
- 摘要：多向药理学计算方法为药物重定位和毒副作用预测提供了有力工具.靶标预测平台PharmMapper采用反向药效团匹配策略,并整合了配套的靶标数据库.但是,鉴于靶标数据库之间的差异难以衡量,直接将靶标得分作为不同药物之间的评价...
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- Linker Library:基于几何特征的骨架跃迁片段库被引量：0收藏
- 作者：李璐 廖奕晨 沈子豪 李洪林 李诗良
- 机构：华东理工大学药学院
- 来源：《华东理工大学学报(自然科学版)》 2023
- 关键词：骨架跃迁 几何特征 片段库 Linker Library 药物设计
- 摘要：骨架跃迁是目前应用最广泛的药物设计策略之一,但是现有骨架跃迁方法产生的化合物大多为已报道的先导化合物的衍生物或类似物,化学结构缺乏新颖性。针对现有骨架跃迁方法的局限性,提出了一种保持药效团与骨架之间的相对距离和角度不变的...
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