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基于人工智能的药物-靶标相互作用预测被引量:4收藏 分享
作者:杨朔 王洁 张梦婷 沈子豪 李洪林 李诗良
机构:华东理工大学新药设计重点实验室
来源:《中国现代应用药学》  2022
关键词:药物-靶标相互作用  深度学习  概率矩阵分解算法  靶标预测  
摘要:目的建立一个高效的药物-靶标相互作用预测分类模型,为生物实验提供有力的补充工具。方法研究开发一种基于深度学习的方法来预测药物-靶标相互作用:通过引入高维分子指纹和蛋白质描述符,并应用概率矩阵分解算法生成负样本集,构建一个...
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基于三元残基组合对的蛋白质相互作用研究被引量:1收藏 分享
作者:肖薇 何增辉 李诗良 李洪林
机构:华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院
来源:《药学学报》  2017
关键词:蛋白质-蛋白质相互作用  “三棱柱”模型  三元残基组合对  
摘要:蛋白质-蛋白质相互作用的作用机制对生命科学研究有着重要意义。目前已有的方法多偏向于氨基酸残基的偏好性研究,并没有给出对应的残基组合的空间信息,而这些空间信息对设计蛋白质-蛋白质相互作用至关重要。通过深入挖掘已有的蛋白质相...
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新型法尼基转移酶抑制剂的发现及构效关系分析被引量:1收藏 分享
作者:张明 李诗良 朱丽丽 黄瑾 赵振江 李洪林
机构:华东理工大学药学院上海市新药设计重点实验室
来源:《药学学报》  2019
关键词:法尼基转移酶  抑制剂  虚拟筛选  构效关系分析  
摘要:本文选择法尼基转移酶(FTase)作为靶标,利用计算机辅助药物设计Schr?dinger软件包中Glide v4.0程序进行虚拟筛选,获得了13个结构新颖、具备中等活性法尼基转移酶抑制剂(FTIs)苗头化合物。通过分析代...
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Linker Library:基于几何特征的骨架跃迁片段库被引量:0收藏 分享
作者:李璐 廖奕晨 沈子豪 李洪林 李诗良
机构:华东理工大学药学院
来源:《华东理工大学学报(自然科学版)》  2023
关键词:骨架跃迁  几何特征  片段库  Linker Library  药物设计  
摘要:骨架跃迁是目前应用最广泛的药物设计策略之一,但是现有骨架跃迁方法产生的化合物大多为已报道的先导化合物的衍生物或类似物,化学结构缺乏新颖性。针对现有骨架跃迁方法的局限性,提出了一种保持药效团与骨架之间的相对距离和角度不变的...
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新型长效DPP-IV抑制剂的发现与设计被引量:0收藏 分享
作者:徐洪玲 李诗良 赵振江 徐玉芳 李洪林
机构:华东理工大学药学院、上海市新药设计重点实验室
来源:《中国药理学通报》  2015
关键词:抑制剂  国际糖尿病联盟  慢性非传染性疾病  设计  患病人数  一线治疗  Ⅱ型糖尿病  胃肠道紊乱  
摘要:糖尿病是当前威胁全球人类健康的最重要的慢性非传染性疾病之一.据国际糖尿病联盟(IDF)的统计表明,目前全球约3.82亿人患糖尿病,仅2013年,全球有510万人死于与糖尿病相关的疾病,占所有死亡人数的8.39%.而中国2...
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