文献类型：期刊文献

中文题名：海洋真菌灰绿曲霉地标蛋白编码基因AgTeaA的克隆与序列分析

英文题名：Cloning and Sequence Analysis of the AgTeaA Gene Encoding Landmark Protein in Marine-derived Fungus Aspergillus glaucus

作者：张盈[1];沈伟[1];蔡孟浩[1];周祥山[1];张元兴[1]

机构：[1]华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室,上海200237

年份：2011

卷号：27

期号：12

起止页码：157

中文期刊名：生物技术通报

外文期刊名：Biotechnology Bulletin

收录：CSTPCD;;北大核心:【北大核心2008】；CSCD:【CSCD_E2011_2012】；

语种：中文

中文关键词：灰绿曲霉;极化生长;地标蛋白;基因克隆

外文关键词：Aspergillus glacus Polarized growth Landmark protein Gene cloning

摘要：为考察灰绿曲霉中地标蛋白AgTeaA对菌丝极化生长的作用,首先需要获得AgTeaA基因序列的相关信息。通过简并PCR的方法得到AgTeaA基因编码区的一段序列,以已知序列为基础通过染色体步移的方法获得基因全长及两端侧翼序列,然后通过逆转录PCR的方法确定出氨基酸序列,并利用相关生物学软件进行蛋白结构域的分析和系统进化树的构建。结果显示,AgTeaA基因编码区全长4 706 bp,对应氨基酸全长为1 477 aa,在256-320 bp,733-780 bp,1064-1150 bp处各有一个内含子。与粟酒裂殖酵母Tea1蛋白和构巢曲霉TeaA蛋白相似的是,AgTeaA在290-339 aa,340-390 aa处各有一个Kelch结构域,在818-899 aa,938-999 aa,1 021-1 116 aa,1 183-1 335 aa处各有一个卷曲螺旋(coiled coil)结构域。
To indentify the role of landmark protein AgTeaA in polarized growth in marine A.glaucus,degenerate PCR and genome walking methods were used to obtain the full gene sequences and flanking regions of AgTeaA,followed by reverse transcription PCR to indentify the amino acid sequences.Afterwards conserved domain analysis and phylogenetic tree construction of the protein was performed using the relevant biological software.The predicted AgTeaA protein is 1 477 aa in length and the putative length of AgTeaA ORF is 4 706 bp with three introns at 256-320 bp,733-780 bp and 1 064-1 150 bp sites.Similarly to the S.pombe Tea1 and A.nidulans TeaA,the AgTeaA harbors two Kelch domains at 290-339 aa and 340-390 aa sites and four coiled coil domains at 818-899 aa,938-999 aa,1 021-1 116 aa and 1 183-1 335 aa sites.