文献类型：会议论文

中文题名：基于蛋白质结合位点相似性的靶标-配体多重对映关系研究

作者：李诗良[1];蔡超前[1];李洪林[1];

机构：[1]华东理工大学药学院上海市新药设计重点实验室;

会议论文集：2019中国化学会第十五届全国计算（机）化学学术会议论文集

会议日期：20191114

会议地点：中国上海

语种：中文

中文关键词：药物重定位;药物靶标预测;蛋白质功能位点比较;序列非依赖性;匈牙利算法

摘要：原创新药的研发投入逐年增高且失败风险逐年增大,因此,药物重定位凭借其大幅度缩减的研发成本已经成为国内外制药企业及科研院所非常重视并采用的药物研发策略。基于蛋白质相似性的靶标预测作为基于靶标-疾病关联的药物重定位研究的核心技术之一,已在预测药物新适应症上取得了很大成功。然而,只考虑蛋白质一级序列或三维结构的相似性易忽略在序列或者结构上不同源,但却享有相似甚至相同小分子识别位点的靶标。因此,发展能准确预测蛋白质结合位点相似性的方法将为基于靶标相似性的药物重定位研究提供有利的补充工具。目前虽已有相关方法报道,但计算精度及计算速度严重限制了其发展和应用。本研究开发不依赖蛋白质一级序列和三维结构同源性的准确、快速的结合位点评价方法Pocket Shape,并将其应用于靶标-配体多重对映关系研究。