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A型流感病毒M2通道蛋白开闭机制:His37和Trp41间的氢键及阳离子-π作用的计算研究    

文献类型:期刊文献

中文题名:A型流感病毒M2通道蛋白开闭机制:His37和Trp41间的氢键及阳离子-π作用的计算研究

作者:程家高[1];朱维良[2];王岩丽[1];闫秀花[2];李忠[1];唐赟[1];蒋华良[1]

机构:[1]华东理工大学药学院,上海200237;[2]中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心

年份:2008

卷号:38

期号:4

起止页码:340

中文期刊名:中国科学(B辑)

外文期刊名:Science in China(Series B)

收录:北大核心:【北大核心2004】;CSCD:【CSCD2011_2012】;

基金:国家自然科学基金(批准号:20572117);上海市博士后科研资助计划(批准号:Y200-2-08)项目

语种:中文

中文关键词:阳离子-π作用;氢键作用;基质蛋白M2;第一原理计算

摘要:A型流感病毒的M2蛋白为一四聚的离子通道.实验结果显示,通道的通透性可能与His37间的氢键网络,以及His37-Trp41间的阳离子-π作用网络有关.以4-甲基咪唑间的氢键网络模拟通道His37间的氢键作用,以质子化4-甲基咪唑和吲哚芳环体系来模拟His37和Trp41间的阳离子-π作用,用量子化学MP2/6-311G**方法开展计算研究.结果显示,氢键网络中咪唑环间的每个N—H…N氢键作用强度可达-6.2kcal.mol-1;阳离子-π作用网络中的每对阳离子-π作用最高可达-18.8kcal.mol-1(T-型作用构象)或-12.3kcal.mol-1(平行堆积型).因此,我们计算得到的作用能表明,通过pH调控氢键作用和阳离子-π作用网络进而调控M2通道的通透性是可能的.

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