文献类型：期刊文献

中文题名：杂交油菜ISSR-PCR反应体系的建立和优化

英文题名：Establishment and Optimization of ISSR-PCR System for Hybrid Rapeseed

作者：彭秉玉[1];胡延萍[2];巩爱岐[1];王焕强[1];王莉[2];包天忠[1];李瑞欣[3];李毅[2]

机构：[1]青海省种子管理站,西宁810000;[2]中国科学院西北高原生物研究所高原生物适应与进化重点实验室,西宁810001;[3]华东理工大学食品科学与工程系,上海201424

年份：2010

卷号：30

期号：5

起止页码：576

中文期刊名：植物研究

外文期刊名：Bulletin of Botanical Research

收录：CSTPCD;;北大核心:【北大核心2008】；CSCD:【CSCD2011_2012】；

基金：国家科技支撑计划(编号2007BAD64B04);2009年中国科学院"西部之光"人才培养计划项目

语种：中文

中文关键词：杂交油菜;ISSR—PCR;反应体系;正交试验设计

外文关键词：Hybrid Rapeseed ; ISSR-PCR ; reaction conditions ; orthogonal design

摘要：利用正交试验设计的方法,对影响ISSR-PCR反应的Mg2+、dNTP、引物和Taq DNA聚合酶4个因素进行优化试验,以期建立其最佳反应条件。并在此基础上,对DNA模板浓度和ISSR-PCR反应程序中的退火温度进行梯度筛选。结果表明:杂交油菜20μL ISSR-PCR最佳反应体系包括1.50 mmol.L-1Mg2+、0.125 mmol.L-1dNTP、2.00μmol.L-1primer、0.50 UTaqDNA聚合酶、2.5μL10×buffer和40 ng DNA模板;引物UBC891适宜的退火温度为54.2℃。该体系在青杂3号及其父本不同个体中能够扩增出条带清晰、稳定性好的条带。ISSR-PCR反应体系的建立为利用分子标记技术研究杂交油菜品种纯度和真实性鉴定奠定了良好基础。
An orthogonal design was used to optimize the ISSR-PCR system for hybrid rapeseed at three levels of four factors（Mg2＋,dNTP,primer and Taq DNA polymerase）.Then,based on the optimal ISSR-PCR amplification system,the concentration of DNA template and annealing temperature were selected.As a result,the optimal PCR（20 μL） mixture contained 1.50 mmol·L-1 Mg2＋,0.125 mmol·L-1 dNTP,2.00 μmol·L-1 primer,0.50 U Taq DNA polymerase,2.5 μL 10×buffer and 40ng template DNA.The suitable annealing temperature of primer UBC891 was 54.2℃.With the optimal system of ISSR-PCR reaction,clear and steady bands were obtained in different individuals of Qingza No.3 and its male parent.The establishment of ISSR-PCR system could favor the studies on the purity and genuineness of hybrid rapeseed varieties by using molecular marker techniques.