文献类型：会议论文

中文题名：新发的可感染人的隐孢子虫花栗鼠基因型I的亚型区分工具的建立

作者：郭亚琼[1,2];Elizabeth Cebelinski[3];Christine Matusevich[4];Kerri A.Alderisio[5];Marianne Lebbad[6];John Mc Evoy[7];Dawn M.Roellig[2];冯耀宇[1];肖立华[2]

机构：[1]华东理工大学资源与环境工程学院生物反应器工程国家重点实验室;[2]美国疾病预防控制中心国家新发和人兽共患传染病中心;[3]明尼苏达州卫生部公共卫生实验室;[4]佛蒙特州卫生实验部;[5]纽约市环保部;[6]瑞典公共卫生部;[7]北达科达州立大学兽医微生物科学系

会议论文集：中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会第十三次学术研讨会论文集

会议日期：20150725

会议地点：中国黑龙江哈尔滨

主办单位：中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会

语种：中文

中文关键词：隐孢子虫;基因型

摘要：隐孢子虫花栗鼠基因型Ⅰ是一种新发的可感染人的病原。但目前针对于该病原还没有有效的亚型区分工具,因此无法判断动物源传播在该病原的流行中所发挥的作用。为了搜寻可用于亚型区分的遗传标记,我们对一株人感染的花栗鼠基因型Ⅰ分离株的基因组进行了测序,共获得853条重叠群序列,由此获得的拼接序列总长为9,509,783 bp,测序深度约为227×。根据获得的全基因组数据,筛选出了一个编码60-kDa的糖蛋白（g1p60）基因和一个编码黏蛋白基因（cdg170）来建立亚型区分工具。采用建立的亚型区分工具对25个来自于美国和瑞典的人源样品、3个来自于纽约集水区附近的啮齿动物源样品和4个纽约集水区水样中包含的花栗鼠基因型Ⅰ进行了亚型区分。在gp60位点上,共发现了15个亚型。尽管在人、动物和水源中检出的花栗鼠基因型Ⅰ的亚型都不相同,但是这些亚型主要在编码丝氨酸重复序列区的三核苷酸（TCA,TCG或TCT）拷贝数上存在差异。在非重复序列区,仅出现了2个单核苷酸多态性位点。此外,在来自于人的样品中,花栗鼠基因型Ⅰ的亚型分布还呈现出一定的地理差异。相比而言,在黏蛋白位点上仅发现了2个亚型,并且这两个亚型之间仅相差一个30-bp的小卫星拷贝。因此,人源和动物源的隐孢子虫花栗鼠基因型Ⅰ具有遗传相似性,而且动物源传播在人的感染中可能发挥了非常重要的作用。