华东理工大学机构知识库

成果/Result

Novel and potent inhibitors targeting DHODH are broad-spectrum antivirals against RNA viruses including newly-emerged coronavirus SARS-CoV-2被引量：19收藏 分享

作者：Rui Xiong Leike Zhang Shiliang Li Yuan Sun Minyi Ding Yong Wang Yongliang Zhao Yan Wu Weijuan Shang Xiaming Jiang Jiwei Shan Zihao Shen Yi Tong Liuxin Xu Yu Chen Yingle Liu Gang Zou Dimitri Lavillete Zhenjiang Zhao Rui Wang Lili Zhu Gengfu Xiao Ke Lan Honglin Li Ke Xu

机构：State Key Laboratory of Virology;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;State Key Laboratory of Virology;CAS Key Laboratory of Molecular Virology and Immunology

来源：蛋白质与细胞（英文版）  2020

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Artificial Intelligence in Pharmaceutical Sciences被引量：18收藏 分享

作者：Mingkun Lu Jiayi Yin Qi Zhu Gaole Lin Minjie Mou Fuyao Liu Ziqi Pan Nanxin You Xichen Lian Fengcheng Li Hongning Zhang Lingyan Zheng Wei Zhang Hanyu Zhang Zihao Shen Zhen Gu Honglin Li Feng Zhu

机构：College of Pharmaceutical Sciences&The Second Affiliated Hospital;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;Innovation Institute for Artificial Intelligence in Medicine of Zhejiang University;Innovation Center for AI and Drug Discovery;Lingang Laboratory

来源：工程（英文）  2023

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纳米通道单分子检测P53蛋白与DNA的弱相互作用被引量：16收藏 分享

作者：应佚伦 张星 刘钰 薛梦竹 李洪林 龙亿涛

机构：华东理工大学上海市功能性材料化学重点实验室;华东理工大学药学院;中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心

来源：《化学学报》  2013

关键词：纳米通道单分子检测技术  α-溶血素  P53蛋白  弱相互作用  

摘要：利用基于α-溶血素(α-HL)的纳米通道单分子检测技术在单分子水平上探测位于肿瘤抑制蛋白P53 DNA结合域的多肽分子(P53-P)与含有p21waf1/cip1基因结合域的双链DNA(B40)之间弱相互作用.在电场力的...

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基于GPU的矩阵求逆性能测试和分析被引量：11收藏 分享

作者：刘丽 沈杰 李洪林

机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院

来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》  2010

关键词：图形处理器(GPU)  计算统一设备架构(CUDA)  CPU  并行运算  矩阵求逆  

摘要：在CPU串行运算模式下实现大规模矩阵求逆是一个非常耗时的过程。为了解决这一问题,基于NVIDIA公司专为GPU(图形处理器)提供的CUDA(计算统一设备架构),从新的编程角度出发,利用GPU多线程并行处理技术,将矩阵求逆...

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A Small-Scale Medication of Leflunomide as a Treatment of COVID-19 in an Open-Label Blank-Controlled Clinical Trial被引量：8收藏 分享

作者：Ke Hu Mengmei Wang Yang Zhao Yunting Zhang Tao Wang Zhishui Zheng Xiaochen Li Shaolin Zeng Dong Zhao Honglin Li Ke Xu Ke Lan

机构：Department of Respiratory and Critical Care Medicine;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;State Key Laboratory of Virology;Frontier Science Center for Immunology and Metabolism

来源：中国病毒学（英文版）  2020

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G protein-coupled receptors in neurodegenerative diseases and psychiatric disorders被引量：6收藏 分享

作者：Thian-Sze Wong Guangzhi Li Shiliang Li Wei Gao Geng Chen Shiyi Gan Manzhan Zhan Honglin Li Song Wu Yang Du

机构：Kobilka Institute of Innovative Drug Discovery;School of Medicine;Institute of Urology;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;Innovation Center for AI and Drug Discovery

来源：信号转导与靶向治疗（英文）  2023

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基于人工智能的药物-靶标相互作用预测被引量：4收藏 分享

作者：杨朔 王洁 张梦婷 沈子豪 李洪林 李诗良

机构：华东理工大学新药设计重点实验室

来源：《中国现代应用药学》  2022

关键词：药物-靶标相互作用  深度学习  概率矩阵分解算法  靶标预测  

摘要：目的建立一个高效的药物-靶标相互作用预测分类模型,为生物实验提供有力的补充工具。方法研究开发一种基于深度学习的方法来预测药物-靶标相互作用:通过引入高维分子指纹和蛋白质描述符,并应用概率矩阵分解算法生成负样本集,构建一个...

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丁苯那嗪调节TH和突触囊泡转运改善HD的机制研究被引量：4收藏 分享

作者：王如意 范晶菁 李洪林 王蕊

机构：华东理工大学药学院

来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》  2023

关键词：亨廷顿舞蹈症  3-硝基丙酸  丁苯那嗪  多巴胺  

摘要：通过腹腔注射3-硝基丙酸(3-NP)建立亨廷顿舞蹈症(HD)大鼠模型,探究丁苯那嗪(TBZ)改善HD样症状的作用及机制。结果显示,TBZ缓解了3-NP诱导的HD大鼠体重下降和运动障碍,逆转了纹状体中亨廷顿蛋白(Htt)的...

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二氢乳清酸脱氢酶抑制剂的设计、合成和构效关系研究被引量：3收藏 分享

作者：宫荥恢 刘莉 齐甜甜 李洪林 朱丽丽 赵振江

机构：华东理工大学药学院

来源：《药学学报》  2017

关键词：人类二氢乳清酸脱氢酶抑制剂  三氮唑衍生物  自身免疫性疾病  复合物共晶结构  构效关系  

摘要：本文将实验室前期发现的1-丁酰基-3-(4-氯苯基)-5-甲硫基-1H-1,2,4-三氮唑作为人类二氢乳清酸脱氢酶(Hs DHODH)抑制剂设计的苗头化合物,为开展结构优化,首先培养并解析了苗头化合物与Hs DHODH的...

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计算系统生物学:理论、方法及在药物研发中的应用被引量：2收藏 分享

作者：刁妍妍 蔡超前 蒋华良 李洪林

机构：华东理工大学药学院;华东理工大学信息科学与工程学院;中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心

来源：《生命科学》  2010

关键词：计算系统生物学  生物模型  建模方法  

摘要：计算系统生物学是一个多学科交叉的新兴领域,旨在通过整合海量数据建立其生物系统相互作用的复杂网络。数据的整合和模型的建立需要发展合适的数学方法和软件工具,这也是计算系统生物学的主要任务。生物系统模型有助于从整体上理解生物体...

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可降解载药原位水凝胶在眼后段药物缓释的有限元分析被引量：2收藏 分享

作者：竹鑫裕 段春争 李红霞 李洪林

机构：大连理工大学机械工程学院;华东理工大学药学院

来源：《医用生物力学》  2022

关键词：可降解原位水凝胶  药物缓释  眼后段  

摘要：目的探究在水凝胶的降解行为下药物在眼后段的扩散过程,为评估局部药物浓度和优化可降解水凝胶的眼内释药性能提供研究基础。方法通过有限元分析法建立可降解载药原位水凝胶在眼后段的药物传递模型。模型考虑水凝胶的降解作用、眼内压和视...

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Design and Synthesis of a Series of Novel Macrocycle Janus Kinase 2 Inhibitors被引量：1收藏 分享

作者：Yanling Wang Huan Ge Disha Wang Huan He Lu Li Yanyan Diao Zihao Shen Lili Zhu Shiliang Li Zhenjiang Zhao Honglin Li

机构：Shanghai Key Laboratory of New Drug Design

来源：中国化学（英文版）  2019

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高盐饮食通过激活盐皮质受体引发Dahl SS大鼠肾损伤和高血压的新机制被引量：1收藏 分享

作者：李曦 王蕊 李洪林

机构：华东理工大学药学院

来源：《华东理工大学学报(自然科学版)》  2024

关键词：高盐饮食  Dahl SS大鼠  盐敏感高血压  肾损伤  盐皮质激素受体  

摘要：盐敏感高血压作为一种顽固性高血压,其发病机制十分复杂。虽然盐皮质激素受体激活和肾损伤在盐敏感高血压的发展中起关键作用,但具体的病理机制目前并不明确。通过高盐饮食诱导建立达尔盐敏感(Dahl SS)大鼠高血压模型,探究盐敏...

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靶向PD-1的多肽阻断剂的设计及评价被引量：1收藏 分享

作者：全丽娜 刁妍妍 李巧 李文杰 朱丽丽 李洪林

机构：华东理工大学药学院上海市新药设计重点实验室

来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》  2020

关键词：PD-1  多肽阻断剂  抗肿瘤  免疫疗法  

摘要：以PD-1为靶标,设计了靶向结合PD-1的多肽P5-1;通过表面等离子共振(SPR)技术测得P5-1与PD-1的结合亲和力(KD)为0.21μmol/L,并通过分子水平竞争性实验验证P5-1可以阻断PD-1与PD-L1的...

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Molecular Similarity： Methods and Performance被引量：1收藏 分享

作者：Chaoqian Cai Jiayu Gong Xiaofeng Liu Daqi Gao Honglin Li

机构：School of Information Science and Engineering;State Key Laboratory of Bioreactor Engineering

来源：中国化学（英文版）  2013

关键词：molecular similarity, molecular modeling, molecular alignment, virtual screening  

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中药组成分资源和实验数据库研究被引量：1收藏 分享

作者：李建华 刘智超 郑建丽 石泽智 范蜜 李洪林

机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学上海市新药设计重点实验室

来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》  2018

关键词：中药  组成分  数据建模  资源和实验库  

摘要：目前已有的中药数据库缺乏中药组成分资源间的有效关联和实验支持。为此,针对植物类中药组成分,设计了一个面向组成分的资源和实验数据库。首先抽取关键的资源和实验数据,将其分为资源数据、实验能力数据和实验数据;然后定义各类数据内...

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Discovery of a natural fluorescent probe targeting the Plasmodium falciparum cysteine protease falcipain-2被引量：1收藏 分享

作者：Lili Zhu Lei Shan Junsheng Zhu Li Li Shiliang Li Liyan Wang Jiawei Wang Shoude Zhang Hongchang Zhou Weidong Zhang Honglin Li

机构：Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;Department of Natural Product Chemistry;School of Medicine

来源：中国科学（生命科学英文版）  2020

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Drug Design of "Undruggable" Targets被引量：1收藏 分享

作者：Jie Wang Shiliang Li Honglin Li

机构：Shanghai Key Laboratory of New Drug Design

来源：中国化学（英文版）  2019

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基于信誉的新药发现平台信任机制被引量：1收藏 分享

作者：范蜜 李建华 郭卫斌 李洪林

机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院

来源：《华东理工大学学报（自然科学版）》  2015

关键词：信任机制  药物发现  联合研发  信誉  

摘要：针对新药研发需要跨地域、跨学科合作的特点,建立了一个面向天然产物的新药发现平台。为了促进平台上各参与方进行联合研发,进而提高新药研发效率和成功率,需要支持参与方相互间进行可信度的评估,并在合作方间建立可靠的信任关系。本文...

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Correction to:Novel and potent inhibitors targeting DHODH are broad-spectrum antivirals against RNA viruses including newly-emerged coronavirus SARS-CoV-2被引量：1收藏 分享

作者：Rui Xiong Leike Zhang Shiliang Li Yuan Sun Minyi Ding Yong Wang Yongliang Zhao Yan Wu Weijuan Shang Xiaming Jiang Jiwei Shan Zihao Shen Yi Tong Liuxin Xu Yu Chen Yingle Liu Gang Zou Dimitri Lavillette Zhenjiang Zhao Rui Wang Lili Zhu Gengfu Xiao Ke Lan Honglin Li Ke Xu

机构：State Key Laboratory of Virology;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;State Key Laboratory of Virology;CAS Key Laboratory of Molecular Virology and Immunology

来源：蛋白质与细胞（英文版）  2022

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不同剂量(+)-2-(1-羟基-4-环己酮)乙基咖啡酸酯对大鼠关节炎模型和全血炎症模型的药效学研究被引量：1收藏 分享

作者：杨文 刘远儒 李洪林 王蕊

机构：上海市新药设计重点实验室

来源：《中国病理生理杂志》  2018

关键词：(+)-2-(1-羟基-4-环乙酮)乙基咖啡酸酯  胶原诱导性关节炎  花生四烯酸  

摘要：目的:对(+)-2-(1-羟基-4-环己酮)乙基咖啡酸酯(HOEC)在大鼠关节炎模型上进行药效学评价,并利用大鼠全血花生四烯酸(AA)代谢模型,探究引起HOEC对关节炎的非剂量依赖性治疗作用的可能机理。方法:(1)采用大...

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Triazole and Benzotriazole Derivatives as Novel Inhibitors for p90 Ribosomal S6 Protein Kinase 2： Synthesis, Molecular Docking and SAR Analysis被引量：1收藏 分享

作者：Jun Yuan Ye Zhong Shiliang Li Xue Zhao Guoqin Luan Zhenjiang Zhao Jin Huang Honglin Li Yufang Xu

机构：Shanghai Key Laboratory of New Drug Design

来源：中国化学（英文版）  2013

关键词：RSK2  structure-activity relationships  molecular docking  

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基于三元残基组合对的蛋白质相互作用研究被引量：1收藏 分享

作者：肖薇 何增辉 李诗良 李洪林

机构：华东理工大学信息科学与工程学院;华东理工大学药学院

来源：《药学学报》  2017

关键词：蛋白质-蛋白质相互作用  “三棱柱”模型  三元残基组合对  

摘要：蛋白质-蛋白质相互作用的作用机制对生命科学研究有着重要意义。目前已有的方法多偏向于氨基酸残基的偏好性研究,并没有给出对应的残基组合的空间信息,而这些空间信息对设计蛋白质-蛋白质相互作用至关重要。通过深入挖掘已有的蛋白质相...

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新型法尼基转移酶抑制剂的发现及构效关系分析被引量：1收藏 分享

作者：张明 李诗良 朱丽丽 黄瑾 赵振江 李洪林

机构：华东理工大学药学院上海市新药设计重点实验室

来源：《药学学报》  2019

关键词：法尼基转移酶  抑制剂  虚拟筛选  构效关系分析  

摘要：本文选择法尼基转移酶(FTase)作为靶标,利用计算机辅助药物设计Schr?dinger软件包中Glide v4.0程序进行虚拟筛选,获得了13个结构新颖、具备中等活性法尼基转移酶抑制剂(FTIs)苗头化合物。通过分析代...

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Isochamaejasmin induces apoptosis in leukemia cells through inhibiting Bcl-2 family proteins.被引量：0收藏 分享

作者：Zhang, Shou-De Shan, Lei Li, Wei Li, Hong-Lin Zhang, Wei-Dong

机构：Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;School of Pharmacy;Qinghai Academy of Agriculture and Forestry Science;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design

来源：Chinese journal of natural medicines  2015

关键词：(?)-Gossypol  3D Similarity search  Apoptosis  Bcl-2  Isochamaejasmin  Stellera chamaejasme L.  

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Mechanism of nanoparticle aggregation in gas-liquid microfluidic mixing被引量：0收藏 分享

作者：Hongxia Li Xiyang Wang Du Qiao Jiahao Li Weiping Zhu Honglin Li

机构：Key Laboratory for Precision&Non-traditional Machining Technology of Ministry of Education;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design

来源：中国化学快报（英文版）  2024

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Microfluidic separation of particles by synergistic effect of geometry-induced hydrodynamics and magnetic field被引量：0收藏 分享

作者：Du Qiao Hongxia Li Weiping Zhu Lili Zhu Danyang Zhao Honglin Li

机构：Key Laboratory for Precision & Non-traditional Machining Technology of Ministry of Education;Shanghai Key Laboratory of New Drug Design;Lingang Lab

来源：中国化学快报（英文版）  2024

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基于反向药效团匹配的网络药理学方法被引量：0收藏 分享

作者：王霞 潘晨旭 龚家瑜 刘晓峰 李洪林

机构：华东理工大学药学院;华东理工大学信息科学与工程学院;上海市新药设计重点实验室

来源：《中国药理学通报》  2015

关键词：多向药理学计算  靶标识别  药效团匹配  配体-靶标打分矩阵  富集  概率评估  

摘要：多向药理学计算方法为药物重定位和毒副作用预测提供了有力工具.靶标预测平台PharmMapper采用反向药效团匹配策略,并整合了配套的靶标数据库.但是,鉴于靶标数据库之间的差异难以衡量,直接将靶标得分作为不同药物之间的评价...

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二氢乳清酸脱氢酶抑制剂前药的合成和稳定性及活性评价被引量：0收藏 分享

作者：单继伟 齐甜甜 李洪林 朱丽丽 赵振江

机构：华东理工大学药学院

来源：《药学学报》  2018

关键词：二氢乳清酸脱氢酶抑制剂  前药设计  药物稳定性  活性评价  

摘要：本文以课题组前期发现的高活性DHODH抑制剂A为基础,依据前药合成策略,对其羧基进行酯化修饰得到12个前药分子,旨在优化化合物A的稳定性。分子水平抑制活性显示12个前药分子中只有A1~A5有微弱活性,与其作用机制和前药设...

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Structural analysis of recombinant human ubiquitin-conjugating enzyme UbcH5c被引量：0收藏 分享

作者：Fangshu Wu Junsheng Zhu Honglin Li Lili Zhu

机构：Shanghai Key Laboratory of New Drug Design

来源：药学学报（英文版）  2017

关键词：UbcH5c    NF-κB    Ubiquitination    Ubiquitin-conjugating enzyme    Crystal structure    Inflammatory target  

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